La iglesia de São Salvador da Sé es un imponente templo manierista de sencilla arquitectura portuguesa, construido en 1568 por el cardenal D. Henrique. Su construcción pretendía ofrecer a la Diócesis de Angra, creada el 3 de noviembre de 1534, una nueva sede de un obispado, en sustitución de la pequeña iglesia dedicada a São Salvador, construida al comienzo del asentamiento de Angra, que se entendía demasiado modesto para esta función. .
El 18 de noviembre de 1570 se inició la construcción de la nueva catedral, ampliando la primitiva iglesia, con proyecto original de Luís Gonçalves. La obra tardó 48 años en completarse, con al menos un período de interrupción a finales del siglo XVI, durante el conflicto de la crisis dinástica.
El edificio Sé fue profundamente dañado por el terremoto del 1 de enero de 1980, por el derrumbe de la fachada el 5 de julio de 1983 y por el incendio del 23 de septiembre de 1983, lo que provocó la pérdida de una gran colección artística, principalmente de decoración barroca. . El 11 de junio de 1980, el Gobierno Regional de las Azores clasificó la Catedral de São Salvador como Monumento Regional.