Construit en 1570, par ordre du cardinal D. Henrique, sur la paroisse précédente des temps initiaux de la colonie, dans lequel est enterré entre autres, le fournisseur des armées, Pêro Anes do Canto. Dans le style de l’étage, c’était son maître Luís Gonçalves. Face au nord, il contredit l’ancienne coutume des églises avec une chapelle principale face à Jérusalem. Le retable de l’Autel du Santíssimo, d’orfèvrerie angrense (Manuel Carneiro de Lima 1702/20), est un ensemble de choeur, d’influence indo-portugaise, mais de matière ébullaire de cachalot, (XVIIIe siècle), Le grès Ming, probablement arrivé par bateau des Indes, et le plus grand orgue ibérique moderne (Dinarte Machado 1993).